要设置Putty连接Ubuntu服务器的超时时间，可以按照以下步骤操作：
打开Putty并输入服务器的IP地址和端口号，然后点击“Open”按钮连接服务器。
在连接成功后，在Putty的窗口上右键点击标题栏，在弹出的菜单中选择“Change Settings”。
在“Change Settings”窗口中，在左侧选择“Connection”选项，然后在右侧找到“Seconds between keepalives”选项。
在“Seconds between keepalives”选项中输入一个合适的超时时间，表示Putty发送心跳包的时间间隔，以保持连接不超时。
确认设置完成后，点击“Apply”按钮保存设置，然后再次连接服务器即可生效。
通过以上步骤，您可以设置Putty连接Ubuntu服务器的超时时间，避免连接超时导致的断开连接问题。