是的，PHP可以使用JavaScript弹窗来执行脚本。通过在PHP代码中嵌入JavaScript代码，可以在用户访问页面时弹出窗口并执行特定的脚本。例如，可以在PHP中使用以下代码来创建一个弹窗：
echo "<script>alert('Hello, World!');</script>";
这将在用户访问页面时弹出一个包含"Hello, World!"的警告框。通过使用类似的方法，可以执行各种JavaScript脚本来弹出不同类型的窗口或执行其他操作。但需要注意的是，要确保在使用PHP弹窗执行脚本时不会导致安全漏洞或不良影响。