选择Linux Overlay版本，需综合考虑以下因素：
- 内核版本：OverlayFS在Linux内核3.18及以上版本可用，建议使用4.0或更高版本，以支持Overlay2存储驱动，获得更好性能和稳定性。
- 稳定性与性能：Overlay2是推荐选择，性能和稳定性更优，适用于Docker Engine - Community和Docker EE 17.06.02 - ee5及以上版本。
- 特定功能需求：若只需基本文件系统叠加功能，OverlayFS简单设计可满足；若需高级功能，可能需考虑其他文件系统。