在处理setTimeout兼容性问题时，可以采取以下几种方法：
使用polyfill：可以使用现有的polyfill库，如core-js或babel-polyfill，它们提供了一组ES6功能的垫片，包括setTimeout。
自定义兼容性处理：可以编写自定义的兼容性处理函数，判断浏览器是否支持setTimeout，如果不支持则使用其他方法来模拟setTimeout的功能。
使用babel转译：通过使用babel将ES6代码转译成ES5代码，可以解决一些兼容性问题，包括setTimeout的兼容性。
使用webpack等构建工具：在构建工具中配置babel-loader等插件，可以自动将ES6代码转译成ES5代码，以解决setTimeout的兼容性问题。
总的来说，处理setTimeout的兼容性问题需要综合考虑多种方法，并根据具体情况选择最适合的方式来解决。