Spring Boot整合JPA可以很方便地处理复杂关系，例如一对多关系、多对多关系等。以下是处理复杂关系的一般步骤：
Entity定义：首先定义实体类，并在实体类中使用JPA注解（如@OneToMany、@ManyToOne、@ManyToMany等）来描述实体类之间的关系。
Repository定义：定义Repository接口，继承JpaRepository接口，并添加自定义的查询方法来处理实体类之间的关系。
Service层：在Service层中编写业务逻辑，调用Repository中定义的方法来处理实体类之间的关系。
Controller层：在Controller层中编写API接口，调用Service层中的方法来处理请求和响应。
测试：编写测试用例来验证实体类之间的关系是否正确处理。
通过上述步骤，可以很方便地利用Spring Boot整合JPA处理复杂关系。同时，Spring Boot提供了丰富的文档和示例，可以帮助开发者更快地上手和理解使用JPA处理复杂关系的方法。