在Linux系统中，卸载libmtp（Media Transfer Protocol）通常不会导致数据丢失。libmtp是一个用于实现MTP（Media Transfer Protocol）的库，它允许应用程序通过MTP协议与设备（如手机、相机等）进行数据传输。
当你卸载libmtp时，实际上只是从系统的软件包管理器中移除了该库及其相关文件。这并不会影响到已经通过libmtp进行的数据传输或存储在设备上的数据。然而，需要注意的是，在卸载之前，确保你已经使用libmtp或其他工具正确地备份了所有重要的数据，以防止任何意外的数据丢失。
此外，如果你在使用libmtp时遇到了问题或错误，建议查阅相关的文档或寻求社区支持，以获取更具体的解决方案和建议。