在MySQL中，减少数据去重查询时间的方法有很多。以下是一些建议：
使用索引：为需要去重的列创建索引，这样MySQL可以更快地定位到唯一的记录。但请注意，创建过多的索引可能会影响插入和更新操作的性能。
选择合适的数据类型：使用最小的合适数据类型来存储数据，以节省存储空间并提高查询效率。
分区表：将大表分成多个较小的分区表，这样查询时只需要扫描相关的分区，而不是整个表。
使用DISTINCT关键字：在查询时使用DISTINCT关键字来去除重复记录。如果你只需要去重某一列，可以使用GROUP BY子句。
使用临时表：将去重后的数据存储在一个临时表中，然后从临时表中查询数据。这样可以避免在原表中执行复杂的去重操作。
优化查询语句：检查查询语句，确保没有不必要的JOIN操作、子查询或其他可能导致性能下降的操作。
使用缓存：如果查询结果不经常变化，可以考虑使用缓存来存储查询结果，以减少对数据库的访问次数。
调整MySQL配置：根据服务器的硬件资源和负载情况，调整MySQL的配置参数，例如innodb_buffer_pool_size、sort_buffer_size等，以提高查询性能。
升级硬件：如果服务器硬件资源不足，可以考虑升级CPU、内存或存储设备，以提高数据库性能。
考虑使用分布式数据库：如果数据量非常大，可以考虑使用分布式数据库，将数据分布在多个服务器上，以提高查询性能。