在C#中，使用XmlDocument类处理XML文档时，可以采取以下措施确保数据完整性：
使用合适的XML命名空间：确保在处理XML文档时使用正确的命名空间，以避免元素名称冲突和数据解析错误。
验证XML文档结构：在处理XML文档之前，可以使用XML Schema（XSD）或XML Document Object Model（DOM）验证XML文档的结构是否符合预期。这有助于确保数据完整性。
使用强类型类：为XML文档中的数据创建强类型类，以便在处理XML数据时更容易捕获错误。使用强类型类还可以提高代码的可读性和可维护性。
检查空值和边界条件：在处理XML文档时，确保检查空值和边界条件，以防止数据不一致和错误。
使用事务处理：如果需要处理多个相关的XML文档，可以使用事务处理来确保数据的一致性和完整性。事务处理可以确保在处理过程中发生的任何错误都可以回滚，从而保持数据的一致性。
使用异常处理：在处理XML文档时，使用异常处理来捕获和处理可能发生的错误。这有助于确保在发生错误时能够采取适当的措施，从而保持数据的完整性。
使用XSLT转换：如果需要对XML文档进行复杂的转换和处理，可以使用XSLT（Extensible Stylesheet Language Transformations）来实现。XSLT转换可以帮助确保数据在转换过程中的完整性和一致性。
使用XPath和XQuery：使用XPath和XQuery查询语言可以更精确地定位和操作XML文档中的数据。这有助于确保在处理大量数据时不会遗漏任何重要信息，从而保持数据的完整性。
使用XmlReader和XmlWriter：使用XmlReader和XmlWriter类可以更高效地读取和写入XML文档。这些类提供了对XML文档的逐行处理能力，有助于在处理大型XML文档时减少内存占用和提高性能。
遵循最佳实践：遵循C#和XML处理的最佳实践，以确保代码的可读性、可维护性和性能。这包括使用合适的编码规范、避免使用过时的API和库等。