PHP和JavaScript中的confirm函数都用于在用户界面中显示一个模态对话框，以确认用户的操作。然而，它们之间存在一些关键区别：
服务器端与客户端：PHP是服务器端脚本语言，而JavaScript是客户端脚本语言。这意味着PHP代码在服务器上执行，然后将结果发送到客户端（浏览器）进行显示。而JavaScript代码直接在浏览器中执行。
动态内容生成：PHP可以动态生成HTML内容，因此可以在PHP中使用confirm函数来根据服务器端数据生成不同的确认对话框。而JavaScript的confirm函数仅能显示静态的文本和按钮，不能根据客户端数据动态改变。
与表单提交关联：在使用PHP处理表单数据时，通常会将表单提交到服务器进行处理。在这种情况下，可以使用PHP中的confirm函数来确认用户是否希望提交表单。而在JavaScript中，可以使用confirm函数来阻止表单的默认提交行为，直到用户确认操作。
刷新页面：当使用PHP的confirm函数时，如果用户点击“确定”，页面将刷新，因为PHP代码在服务器上执行。而在JavaScript中，使用confirm函数不会导致页面刷新，因为操作仅在客户端执行。
总之，PHP和JavaScript中的confirm函数都用于显示确认对话框，但它们在服务器端与客户端执行、动态内容生成、表单提交关联以及页面刷新方面有所不同。在实际应用中，可以根据需要选择使用哪种语言和功能。