在Eclipse中编译Java源代码生成class文件的方法是通过点击菜单栏中的"Project" -> “Build Project”，或者使用快捷键Ctrl + B。这将会编译当前项目中所有的Java源代码文件，并生成相应的class文件。在Eclipse中也可以设置自动编译选项，这样在保存源代码文件时就会自动进行编译。