在Debian上选择MongoDB存储引擎，需结合应用场景和需求：
- 推荐WiredTiger：从MongoDB 3.2起默认使用，支持文档级并发控制、事务、压缩和高效内存管理，适用于高并发读写、数据量大、需持久化的场景，性能和可靠性最佳。
- 考虑In-Memory：若需极致读写速度且内存充足，可选择该引擎，但数据不持久化，适合临时高速缓存场景。
- 避免MMAPv1：该引擎为早期默认引擎，不支持事务、锁粒度粗、无压缩，仅适用于遗留系统或特殊兼容性需求，新版本中不推荐。
选择时可通过修改/etc/mongod.conf中storage.engine参数配置，切换前需备份数据并确认兼容性。