SQL Server在CentOS中的兼容性问题主要包括以下方面：
- 版本兼容性：SQL Server 2017及以后版本支持CentOS，但不同版本对CentOS版本有要求，如SQL Server 2022建议安装在CentOS 8或更高版本。
- 依赖项问题：安装时可能需手动安装特定依赖库，如CentOS 9上安装SQL Server 2022可能需处理依赖关系。
- 配置与权限：需正确配置防火墙（开放1433端口）、SELinux策略，以及处理字符集设置、数据库初始化等问题。
- 性能差异：因文件系统（如XFS/ext4与NTFS）、内存管理机制不同，CentOS上的SQL Server性能可能低于Windows，需进行硬件、配置及查询优化。
- 高可用性限制：SQL Server对CentOS的高可用性支持有限，可考虑部署MariaDB等替代方案。