是的，C++中的pragma指令可以影响模板实例化。通过使用pragma指令，可以在代码中控制编译器的行为，包括模板的实例化过程。例如，可以使用#pragma GCC optimize指令来优化模板实例化的过程，以提高编译器的性能。
另外，一些编译器还提供了特定的pragma指令来控制模板实例化的行为，例如控制模板的显示实例化、禁用特定的模板实例化等。因此，通过使用pragma指令，可以对模板实例化进行调整和优化，以满足特定的需求。