常用的云服务器文件管理工具有：
1. FileZilla：一款免费的FTP客户端，支持多个操作系统，可以实现文件的上传、下载、删除等功能。
2. WinSCP：一个Windows平台上的SFTP、SCP和FTP客户端，可以在本地和远程服务器之间进行文件传输和管理。
3. Cyberduck：一款跨平台的开源FTP、SFTP、WebDAV、Amazon S3等协议的客户端，支持Windows和Mac系统。
4. Transmit：一款Mac平台上的FTP、SFTP、WebDAV、Amazon S3等协议的客户端，界面简洁美观，功能强大。
5. SmartFTP：一款Windows平台上的FTP、SFTP、WebDAV、Amazon S3等协议的客户端，支持多线程传输和自动同步功能。
6. rsync：一个用于文件同步和备份的工具，可以通过SSH协议在本地和远程服务器之间进行文件传输和同步。
以上是一些常用的云服务器文件管理工具，可以根据个人需求选择适合自己的工具。