BLAST blastn blastp

BLAST中blastn和blastp的区别有哪些

小亿
919
2023-08-03 15:40:29
栏目: 编程语言

BLAST中的blastn和blastp是两个不同的搜索工具,其区别如下:

  1. 基本原理:blastn是用于核酸序列之间的比对,而blastp则是用于蛋白质序列之间的比对。

  2. 输入类型:blastn接受核酸序列作为输入,而blastp接受蛋白质序列作为输入。

  3. 比对算法:blastn使用核酸序列间的碱基匹配来进行比对,而blastp使用蛋白质序列间的氨基酸匹配。

  4. 匹配评分:blastn使用核酸间的碱基匹配评分系统,而blastp使用蛋白质间的氨基酸匹配评分系统。

  5. 输出结果:blastn的输出结果会给出两个核酸序列之间的相似度和比对位置等信息,而blastp的输出结果会给出两个蛋白质序列之间的相似度、比对位置以及预测的结构和功能等信息。

总的来说,blastn和blastp是针对不同类型的生物分子序列设计的搜索工具,分别用于核酸序列和蛋白质序列的比对和分析。

0
看了该问题的人还看了