BLAST中的blastn和blastp是两个不同的搜索工具，其区别如下：
基本原理：blastn是用于核酸序列之间的比对，而blastp则是用于蛋白质序列之间的比对。
输入类型：blastn接受核酸序列作为输入，而blastp接受蛋白质序列作为输入。
比对算法：blastn使用核酸序列间的碱基匹配来进行比对，而blastp使用蛋白质序列间的氨基酸匹配。
匹配评分：blastn使用核酸间的碱基匹配评分系统，而blastp使用蛋白质间的氨基酸匹配评分系统。
输出结果：blastn的输出结果会给出两个核酸序列之间的相似度和比对位置等信息，而blastp的输出结果会给出两个蛋白质序列之间的相似度、比对位置以及预测的结构和功能等信息。
总的来说，blastn和blastp是针对不同类型的生物分子序列设计的搜索工具，分别用于核酸序列和蛋白质序列的比对和分析。