当Tomcat打开的文件过多时，可以考虑以下几种处理方式：
增加系统文件打开限制：可以通过修改操作系统的文件打开限制来增加Tomcat所能打开的文件数。具体的修改方法可以参考操作系统的文档或者搜索相关方法。
优化Tomcat配置：可以通过调整Tomcat的配置文件来优化文件打开数。例如，可以调整Tomcat的线程池大小或者增大连接器的最大连接数。
关闭不必要的应用程序：如果Tomcat打开的文件过多是因为有大量的应用程序在运行，可以考虑关闭一些不必要的应用程序，减少文件打开数。
使用连接池：如果Tomcat是通过连接池来管理数据库连接的，可以考虑调整连接池的配置，减少连接数或者增加连接池的大小，从而减少文件打开数。
定期清理无用的文件：可以定期清理Tomcat服务器上的无用文件，如日志文件、临时文件等，以减少文件打开数。
升级Tomcat版本：如果Tomcat打开文件过多是因为Tomcat版本的问题，可以考虑升级到最新的稳定版本，可能会有相关的优化和修复。
需要根据具体情况选择合适的处理方式，并确保处理过程中不会引起其他问题。