在 CentOS 系统中，优化 PHP 慢查询主要涉及到以下几个方面：
优化 MySQL 数据库：
a. 为数据库表添加索引：确保查询中涉及的字段都已经建立了索引，这将大大提高查询速度。
b. 优化 SQL 查询：避免使用 SELECT *，而是只查询需要的字段；尽量减少 JOIN 操作；使用 LIMIT 限制返回结果数量。
c. 调整 MySQL 配置：根据服务器的内存和负载情况，调整 MySQL 的配置参数，例如 innodb_buffer_pool_size、max_connections、query_cache_size 等。
优化 PHP 代码：
a. 使用 PHP 缓存扩展：例如使用 OPCache、APCu 或 Redis 等缓存技术，将经常访问的数据缓存起来，减少数据库查询次数。
b. 减少循环中的数据库查询：尽量避免在循环中执行数据库查询操作，可以考虑使用批量查询或者将查询结果存储在数组中。
c. 使用预处理语句：预处理语句可以提高查询性能并防止 SQL 注入攻击。
优化 Web 服务器配置：
a. 调整 PHP-FPM 配置：根据服务器的性能和负载情况，调整 PHP-FPM 的配置参数，例如 pm.max_children、pm.start_servers、pm.min_spare_servers、pm.max_spare_servers 等。
b. 开启 HTTP 缓存：使用 Nginx 或 Apache 的缓存功能，将静态资源缓存起来，减少服务器负载。
c. 使用负载均衡：如果服务器负载较高，可以考虑使用负载均衡技术，将请求分发到多台服务器上。
监控和分析：
a. 使用慢查询日志：开启 MySQL 的慢查询日志功能，记录执行时间较长的 SQL 查询，以便分析和优化。
b. 使用性能分析工具：例如使用 Xdebug 或 Blackfire 等工具，分析 PHP 代码的性能瓶颈，进行针对性的优化。
通过以上方法，可以有效地优化 CentOS 系统中的 PHP 慢查询问题。在实际操作中，需要根据具体情况进行调整和优化。