MySQL数据库是通过将数据保存在文件中来实现持久性的。MySQL数据库包含多个数据文件，其中包括表定义文件（.frm文件）和存储数据文件（.ibd文件）。表定义文件保存了表的结构信息，包括列名、数据类型等。存储数据文件保存了表中的实际数据。当数据被插入、更新或删除时，MySQL会将这些操作写入到存储数据文件中，以确保数据的持久性。
此外，MySQL还会生成日志文件来记录数据库的操作，包括二进制日志文件、错误日志文件、查询日志文件等。这些日志文件可以用于数据恢复、故障排除等操作。
总的来说，MySQL数据库通过将数据保存在文件中来实现持久性，确保数据在数据库关闭或重启后仍然能够被正确访问和操作。