Web应用可以通过以下几种方式来访问MySQL数据库：
使用PHP：PHP是一种服务器端编程语言，可以与MySQL数据库进行连接和交互。通过PHP的MySQL扩展或者PDO扩展，可以实现从Web应用中访问MySQL数据库，并执行查询、插入、更新和删除操作。
使用Java：Java是一种强大的编程语言，可以通过JDBC（Java Database Connectivity）来连接MySQL数据库。开发人员可以使用JDBC API来编写Java代码，实现与MySQL数据库的交互。
使用Python：Python也可以用来开发Web应用，并通过PyMySQL或者SQLAlchemy等库来连接MySQL数据库。开发人员可以使用Python来编写数据库查询和操作的逻辑。
使用Node.js：Node.js是一个基于JavaScript的服务器端运行环境，可以使用Node.js的MySQL模块来连接MySQL数据库。通过Node.js，开发人员可以编写JavaScript代码来访问和操作MySQL数据库。
无论使用哪种编程语言或框架，开发人员需要在Web应用中配置数据库连接参数（如主机名、用户名、密码、数据库名等），以及编写SQL查询语句来实现对MySQL数据库的访问和操作。同时，为了保证数据安全性，开发人员还需要注意防止SQL注入等安全问题。