Notepad++本身并不支持版本控制功能，因为它主要是一个文本编辑器，而不是一个专门的版本控制工具。版本控制通常使用如Git这样的分布式版本控制系统来管理代码的变更历史。如果你需要在Debian系统上对Notepad++的配置或插件进行版本控制，你可以考虑以下几种方法：
手动管理配置文件：将Notepad++的配置文件（通常位于~/.notepad++目录下）进行手动备份和管理。你可以使用文件压缩工具（如tar或zip）来创建配置文件的备份，并在需要时进行解压和恢复。
使用外部版本控制工具：你可以使用外部的版本控制工具，如Git，来管理Notepad++的配置文件和插件。首先，你需要在Debian系统上安装Git，然后初始化一个Git仓库来管理你的配置文件。
使用插件管理工具：对于Notepad++的插件，你可以使用插件管理工具（如NppFTP、Plugin Manager等）来安装、更新和卸载插件。这些工具通常会提供自己的版本控制功能，或者你可以将插件的配置文件和插件文件本身纳入Git等版本控制系统中进行管理。
请注意，上述方法并不是在Notepad++软件内部进行的版本控制，而是通过外部工具和手动管理来实现的。如果你需要在Debian系统上进行代码版本控制，建议使用专门的版本控制工具，如Git，并遵循相关的最佳实践进行操作。