在Linux系统中，Overlay文件系统通常用于将两个或多个目录合并为一个单一的视图。这可以通过mount命令的-o overlay选项来实现。Overlay文件系统的配置文件位置取决于你的具体使用场景和系统设置。
以下是一些常见的Overlay配置文件位置：
/etc/fstab中添加一行来配置Overlay文件系统。例如：overlay /mnt/overlay overlay defaults,lowerdir=/path/to/lowerdir,upperdir=/path/to/upperdir,workdir=/path/to/workdir 0 0
在这个例子中，/mnt/overlay是要挂载Overlay文件系统的目标目录，lowerdir、upperdir和workdir分别指定了底层目录、上层目录和工作目录。
/etc/init.d/ 或 /etc/systemd/system/：如果你使用的是基于init或systemd的系统，你可以在相应的启动脚本或服务单元文件中配置Overlay文件系统。例如，在systemd服务单元文件中，你可以添加ExecStartPre指令来执行mount命令。
用户自定义脚本：你还可以编写自己的脚本来配置Overlay文件系统，并在需要时手动运行该脚本。这种方法提供了更大的灵活性，但需要你自己管理脚本的执行。
请注意，具体的配置文件位置和格式可能因Linux发行版和系统设置而异。因此，在进行配置之前，请查阅你所使用的Linux发行版的文档以获取准确的信息。
另外，如果你是在容器环境中使用Overlay文件系统（如Docker），那么配置文件的位置和格式可能会有所不同。在这种情况下，请查阅相关容器技术的文档以获取准确的信息。