要在Android原生代码中进行手动调试，您可以按照以下步骤进行操作：
打开您要调试的原生代码文件。您可以在Android Studio中找到这些文件，通常位于项目的"app/src/main/cpp"目录下。
在需要进行调试的代码行之前添加一个断点。断点是调试的关键，它会使程序在该行暂停执行，以便您检查变量的值和程序的状态。
连接您的Android设备或启动模拟器，并确保您的设备已启用USB调试模式。您可以在设备的开发者选项中启用该功能。
在Android Studio中，点击左上角的"Debug"按钮，选择您要调试的应用程序。如果您还没有创建一个调试配置，您可以点击"Edit Configurations"来创建一个新的调试配置。
单击"Debug"按钮之后，Android Studio将编译并安装您的应用程序，并在设备上启动调试会话。如果您的设备上已经安装了该应用程序，Android Studio将会直接启动调试会话。
当程序执行到您添加断点的行时，它会暂停执行并显示您的代码。您可以使用调试窗口中的工具来检查变量的值、单步执行代码、查看函数调用栈等。
您可以使用调试窗口中的控制按钮来控制程序的执行，例如继续执行、单步执行、跳过当前行、停止调试等。
通过上述步骤，您可以在Android原生代码中进行手动调试并查找问题所在。请注意，Android Studio提供了丰富的调试工具和功能，您可以根据您的需要使用它们来提高调试效率。