CPU降频会直接降低其处理能力，导致系统运行速度变慢。例如，运行大型软件（如视频编辑、3D渲染）、游戏或多线程任务时，可能出现明显的卡顿、加载时间延长或响应延迟。这是因为CPU频率降低后，单位时间内执行的指令数减少，无法满足高负载任务的需求。
频繁或极端的降频可能引发系统不稳定。例如，当CPU因温度过高触发降频（thermal throttling）但散热未得到改善时，温度可能持续升高，甚至导致系统自动关机（thermal shutdown），以防止硬件损坏。此外，频繁的频率切换（如从最高频降至最低频）可能引发兼容性问题，导致死机或蓝屏。
降频是CPU自我保护的机制之一，能有效减少发热量。当温度过高时，降低频率可降低晶体管的功耗（功耗与频率近似成正比），从而减少热量产生，避免因过热导致的硬件损坏。对于笔记本电脑等散热空间有限的设备，降频有助于延长电池续航时间。
即使降频未导致系统崩溃，也会影响日常使用的流畅度。例如，浏览网页、编辑文档等轻负载任务可能变得迟缓，实时任务（如音频/视频播放、在线会议）可能出现丢帧或卡顿。对于对延迟敏感的应用（如实时交易系统、在线游戏），降频会直接影响服务质量。
虽然降频本身是为了保护硬件，但长期处于高温环境（即使降频）仍可能加速电子元件老化。例如，高温会增加CPU芯片与主板之间的焊点热应力，可能导致虚焊或断裂（尤其对于老旧设备）。因此，频繁降频可能间接缩短硬件使用寿命。