在PHP中稳定运行MSSQL查询，可以采取以下几个措施：
使用PDO（PHP Data Objects）扩展：PDO是PHP中一个强大的数据库抽象层，支持多种数据库系统，包括MSSQL。通过PDO扩展，可以使用PDO预处理语句来执行SQL查询，提高安全性和效率。
使用SQL参数绑定：避免将用户输入直接拼接到SQL查询中，可以使用参数化查询来防止SQL注入攻击。在PDO中，可以使用bindParam()或bindValue()方法将参数绑定到SQL查询中。
错误处理：在执行MSSQL查询时，要及时捕获和处理可能出现的错误。可以使用try-catch块来捕获异常，并输出错误信息以便调试。
预处理语句：对于需要频繁执行的相似SQL查询，可以使用预处理语句来提高执行效率。PDO的预处理语句可以多次执行相同的SQL查询，只需变更参数值即可。
及时关闭数据库连接：在查询执行完毕后，及时关闭数据库连接以释放资源，防止数据库连接池被耗尽。
通过以上几点措施，可以在PHP中稳定地执行MSSQL查询，提高查询的安全性和效率。