PHP编译器在代码保护方面的功能包括以下几个方面：
代码加密：PHP编译器可以将PHP代码加密，使其难以被破解和篡改，提高代码的安全性。
混淆：PHP编译器可以将代码中的变量名、函数名等信息进行混淆处理，降低代码的可读性，增加代码被破解的难度。
防止反编译：PHP编译器可以对生成的字节码进行特殊处理，防止被反编译成原始的PHP代码。
代码签名：PHP编译器可以对编译后的代码进行数字签名，确保代码的完整性和来源可靠性。
限制访问：PHP编译器可以设置访问权限，限制某些用户对代码的访问和修改。
总的来说，PHP编译器在代码保护方面提供了多种功能和方法，帮助开发者保护其代码的安全性和完整性。但需要注意的是，虽然这些方法可以增加代码的安全性，但并不能完全防止代码被破解和篡改，因此开发者也应该采取其他安全措施来保护其代码。