要通过命令行工具保护Linux服务器，可以采取以下措施：
更新和维护系统：定期更新操作系统和软件包，以修复已知漏洞，并确保服务器的安全性。
使用防火墙：设置防火墙规则以限制对服务器的访问。可以使用防火墙工具如iptables或firewalld来配置和管理防火墙。
禁用不必要的服务：仅启用服务器上需要的服务，并禁用不需要的服务。这样可以减少攻击面并提高安全性。
配置安全性的SSH访问：使用SSH密钥而不是密码进行身份验证，配置SSH以禁用root用户登录，限制SSH访问IP范围，并实施其他安全措施。
使用强密码和多因素身份验证：确保所有用户使用强密码，并启用多因素身份验证以提高登录安全性。
定期备份数据：建立定期备份机制，以防止数据丢失或损坏，并确保备份数据存储在安全的位置。
安装入侵检测系统（IDS）：使用IDS工具如Snort或Suricata来监测服务器上的可疑活动，并及时采取行动。
配置日志记录：启用服务器上的日志记录，并定期检查日志以识别任何异常活动。
定期扫描服务器：使用安全扫描工具如Nessus或OpenVAS来定期扫描服务器以发现潜在的漏洞。
实施安全审计：定期进行服务器的安全审计，并修复发现的问题。
这些措施可以帮助保护Linux服务器免受潜在的安全威胁，并提高服务器的安全性。