在C#中使用MD5加密时，最佳实践包括以下几个方面：
使用安全的实现：建议使用System.Security.Cryptography命名空间中的MD5类来进行MD5加密，而不是使用非安全的实现方式。
使用唯一的加盐值：为了增加加密的强度，可以在原始数据的基础上加入一个唯一的加盐值，然后再进行MD5加密。
避免使用弱密码：MD5虽然是一种常见的加密算法，但已经被证明存在弱点，容易被破解。因此，在对敏感信息进行加密时，建议使用更加安全的加密算法，如SHA-256等。
注意数据完整性：在应用中使用MD5加密时，应当注意数据的完整性，确保数据在传输过程中没有被篡改。
总的来说，使用MD5加密时应当注意选择安全的实现方式、在加密过程中加入唯一的加盐值、避免使用弱密码，并注意数据的完整性，以确保加密的安全性和有效性。