是的，FileZilla在Ubuntu上支持SSL加密，具体可以通过配置FTPS（FTP over SSL/TLS）或SFTP（SSH File Transfer Protocol）来实现。以下是相关介绍：
FTPS（FTP over SSL/TLS）加密传输设置
- 安装FileZilla：在基于Debian的系统（如Ubuntu）中，使用命令：
sudo apt-get install filezilla。
- 配置FileZilla Server：打开FileZilla Server Interface，进入“编辑”菜单，选择“设置”。在“设置”窗口中，选择“传输层安全”>“SSL/TLS设置”。点击“生成新证书”生成个人证书，并按照提示完成设置。在“用户设置”界面下，可以勾选“强制SSL登录”以启用FTPS。
- 配置FileZilla客户端：打开FileZilla客户端，点击“文件”菜单，选择“站点管理器”。添加一个新站点，输入主机名、用户名、密码和端口（例如：14147，如果使用FTPS）。在“传输设置”中选择“显式TLS/SSL”，以确保使用FTPS协议。点击“连接”进行连接。
SFTP（SSH File Transfer Protocol）加密传输设置
- 打开FileZilla，点击“文件”菜单，选择“站点管理器”。点击“新建站点”按钮，在“协议”中选择“SFTP - SSH文件传输协议”。输入远程服务器的IP地址或域名以及端口号（通常为22）。选择“登录类型”为“正常”，输入您的用户名和密码。如果您使用密钥认证，则在“密钥文件”处选择您的私钥文件。点击“连接”。
通过以上步骤，您可以在Linux系统上使用FileZilla通过FTPS或SFTP协议安全地进行文件传输。