在循环中使用Java的substring()方法时，最好避免在每次循环迭代中重复创建新的字符串对象，因为这样会增加内存消耗和性能开销。
一种高效的方法是在循环开始之前将原始字符串提取出需要的子字符串，然后在循环中使用索引来访问子字符串的部分。这样可以避免重复创建字符串对象，提高性能。
另外，如果需要频繁对原始字符串进行子字符串操作，可以考虑使用String.substring()方法的另一个重载方法，即传入开始索引和结束索引，避免多次调用substring()方法。
总的来说，要在循环中高效地使用Java的substring()方法，需要注意避免重复创建字符串对象，尽量减少对原始字符串的操作，并合理利用substring()方法的重载方法。