在开发使用GTK和PHP的应用程序时，安全性是一个非常重要的考虑因素。以下是一些建议，可以帮助你确保你的应用程序安全：
- 输入验证：始终验证用户输入，确保它符合预期的格式和类型。不要信任用户的输入，并使用白名单方法来限制允许的输入。
- 参数化查询：当使用数据库时，始终使用参数化查询来防止SQL注入攻击。避免在查询中直接拼接用户输入。
- 使用安全的库和函数：确保你使用的GTK和PHP库都是安全的，并且已经更新到最新版本。避免使用已知存在安全漏洞的库。
- 限制文件上传：如果你允许用户上传文件，确保对上传的文件进行严格的检查，限制文件类型、大小和数量。不要将用户上传的文件保存在可公开访问的位置。
- 使用安全的会话管理：确保你的应用程序使用安全的会话管理机制，如使用加密的会话ID，并设置适当的会话超时。
- 防止跨站脚本攻击（XSS）：对用户输入进行适当的转义和编码，以防止XSS攻击。避免在页面上直接输出用户输入。
- 使用安全的HTTP头：设置安全的HTTP头，如Content-Security-Policy（CSP）和X-Frame-Options，以增加应用程序的安全性。
- 限制资源访问：确保你的应用程序只允许用户访问他们被授权的资源。使用适当的访问控制和权限管理。
- 定期更新和打补丁：定期更新你的GTK和PHP库以及操作系统，以修复已知的安全漏洞。
- 进行安全审计和测试：在发布应用程序之前，进行安全审计和测试，以发现和修复潜在的安全问题。
总之，安全性是一个持续的过程，需要你在开发过程中始终保持警惕。遵循最佳实践，并定期审查和更新你的安全策略，以确保你的应用程序始终安全。