在Ubuntu系统中，Apache2的主要配置文件是/etc/apache2/apache2.conf。此外，还有其他相关配置文件和目录：
配置文件：
httpd.conf：用户自定义配置文件，通常在/etc/apache2/sites-enabled/000-default中。ports.conf：配置Apache监听的端口。sites-available：存放虚拟主机配置文件，但实际配置文件在sites-enabled目录中，通过符号链接关联。mods-available和mods-enabled：存放模块配置文件和链接。日志文件：
/var/log/apache2/。启动脚本：
/etc/init.d/apache2。