处理MySQL大数据集中的去重操作时，可以采用以下方法来优化性能：
使用索引：为需要去重的列创建索引，这样可以加快查询速度。但请注意，创建过多的索引可能会影响插入和更新操作的性能。
分区表：将大数据集分成多个较小的分区表，每个分区表都可以单独进行去重操作。这样可以减少单次操作的数据量，提高性能。
使用临时表：将需要去重的数据插入到临时表中，然后对临时表进行去重操作。最后，将去重后的数据插入到目标表中。这种方法适用于需要多次去重的场景。
使用聚合函数：使用聚合函数（如COUNT、SUM等）结合GROUP BY子句进行去重。这种方法适用于只需要统计去重数据的场景。
使用窗口函数：在MySQL 8.0及以上版本中，可以使用窗口函数（如ROW_NUMBER()、RANK()等）进行去重。这种方法适用于需要对数据进行排序和去重的场景。
优化查询语句：尽量减少查询中的JOIN操作，避免使用子查询，尽量使用 EXISTS 而不是 IN 等。
调整MySQL配置：根据服务器的硬件资源和负载情况，调整MySQL的配置参数，如innodb_buffer_pool_size、max_allowed_packet等，以提高查询性能。
使用外部工具：如果MySQL无法满足去重操作的性能要求，可以考虑使用外部工具（如Python、Perl等）进行数据处理。
请根据实际情况选择合适的方法进行处理，并在操作前备份相关数据以防意外丢失。