在设置Linux系统变量时可能会遇到一些陷阱，其中一些包括：
不正确的语法：当设置系统变量时，需要确保使用正确的语法。例如，在bash中，变量赋值不应该有空格，应该使用等号作为赋值操作符。
作用域问题：系统变量可以是全局的或者局部的。如果想要变量在整个系统中生效，需要将变量设置在合适的配置文件中，如.bashrc或.profile。如果将变量设置在一个特定的shell会话中，则该变量只在该会话中有效。
覆盖环境变量：有时候设置系统变量可能会覆盖原有的环境变量，导致系统功能异常。在设置变量时应该注意避免重复定义系统变量。
不正确的值：确保设置的系统变量值是正确的，否则可能会导致系统功能异常或者不可预测的结果。
未生效：有时候设置完系统变量后可能不会立即生效，需要重新启动系统或者重启shell会话才能使变量生效。
总的来说，在设置Linux系统变量时，需要确保遵守正确的语法、作用域和值，以避免出现不必要的问题和错误。