在PHP中使用exec()函数处理命令行操作时，确实可以提高脚本的执行效率，但同时也需要注意代码的可维护性和安全性。以下是一些提高可维护性的建议：
最小权限原则：确保运行exec()的PHP脚本用户权限尽可能低，避免以root或管理员权限运行脚本，以减少安全风险。
参数化命令：避免在exec()函数中直接拼接命令字符串，这样可以防止命令注入攻击。使用参数化方法，如sprintf()或call_user_func_array()，来安全地传递参数。
错误处理和日志记录：对exec()的调用结果进行错误处理，并记录到日志文件中，以便于问题追踪和调试。
避免使用eval()：尽量避免使用eval()来执行动态生成的代码，因为它会执行任意传入的字符串，增加了安全风险。如果必须使用，确保传入的字符串是安全的。
使用安全的文件系统函数：在需要读取或写入文件时，使用PHP提供的安全文件系统函数，如file_get_contents()、file_put_contents()等，而不是直接使用系统命令。
环境隔离：如果需要在脚本中执行特定环境的命令，可以使用容器化技术（如Docker）来隔离环境，确保命令的可移植性和一致性。
代码注释和文档：为使用exec()的代码添加详细的注释，说明每个命令的作用、参数和预期结果，以及任何特殊的安全注意事项。
定期审查和更新：定期审查使用exec()的代码，确保其仍然符合当前的安全标准和最佳实践，并及时更新。
通过遵循这些建议，可以在利用exec()提高脚本执行效率的同时，保持代码的可维护性和安全性。