在Debian系统中，使用nohup命令运行程序时，最佳实践包括以下几点：
使用nohup命令：nohup命令可以让程序在用户退出登录后继续运行。它的基本语法是：nohup command &，其中command是要运行的程序，&表示将程序放入后台运行。
输出重定向：为了避免nohup.out文件过大，建议将程序的输出重定向到其他文件。例如，可以将标准输出和标准错误输出重定向到output.log文件中，命令如下：
nohup command > output.log 2>&1 &
使用disown命令：如果你想在程序运行过程中将其从当前shell会话中分离，可以使用disown命令。这样，即使关闭终端，程序也会继续运行。首先，使用jobs命令查看后台运行的任务，然后使用disown命令将任务从shell会话中分离，例如：
jobs
disown %1
其中%1表示要分离的任务编号。
使用screen或tmux：为了更好地管理后台运行的程序，可以使用screen或tmux等终端复用器。这些工具允许你在一个终端窗口中运行多个会话，并在需要时切换会话。此外，它们还允许你在断开连接后重新连接会话，以便查看程序的输出或与之交互。
监控日志文件：定期检查output.log文件，以确保程序正常运行。如果发现错误或异常，请及时处理。
设置日志轮转：为了避免日志文件过大，可以使用logrotate工具设置日志轮转。这样，当日志文件达到指定大小时，logrotate会自动将其归档并创建一个新的日志文件。要配置logrotate，请编辑/etc/logrotate.conf文件或创建一个新的配置文件（例如/etc/logrotate.d/myapp），并添加相应的配置。
遵循以上最佳实践，可以确保在Debian系统中使用nohup命令运行程序时，程序能够稳定、高效地运行。