如果在Ubuntu系统中使用libusb与设备通信出现故障，可以按照以下步骤进行排查：
确保设备连接正确：首先确保设备已经正确连接到计算机上，并且驱动程序已经正确安装。
检查权限：在Ubuntu系统中，默认情况下只有root用户才有权限访问USB设备。您可以通过将用户添加到dialout组或使用sudo命令来获取权限访问USB设备。
检查设备是否被占用：可能有其他程序正在使用USB设备，导致libusb无法访问。您可以使用lsof命令来查找哪个程序正在使用USB设备。
检查libusb版本：确保您使用的是最新版本的libusb库，以确保修复了已知的bug和问题。
检查设备描述符：使用lsusb命令来查看设备的厂商和产品ID，并确保您的程序正确匹配这些ID。
检查程序错误：检查您的程序代码是否有bug或错误，可能是导致通信故障的原因。
通过以上步骤，您应该能够找到导致libusb与设备通信故障的原因，并进行相应的修复。如果问题仍然存在，您还可以尝试在其他系统上运行您的程序，以确认是否是Ubuntu系统特有的问题。