Java Document和DOM（Document Object Model）是两个不同的概念，它们在本质上有一些区别。
Java Document是指Java编程语言中的Document类，它属于Java DOM API的一部分。Document类是表示XML文档的根节点，提供了创建、操作和处理XML文档的方法。Java Document主要用于在Java程序中处理XML文档，它提供了一种方便的方式来操作XML数据。
DOM（Document Object Model）是一种标准的文档对象模型，用于表示和操作HTML和XML文档的结构。DOM定义了文档的层次结构和节点之间的关系，提供了一种访问和操作文档内容的接口。DOM是一种通用的标准，可以在不同的编程语言中实现和使用。
因此，Java Document是Java编程语言中用于处理XML文档的类，而DOM是一种通用的标准文档对象模型。它们的主要区别在于Java Document是Java编程语言中的一个特定类，而DOM是一种通用的标准。