Java的matches()方法的效率取决于传入的正则表达式和字符串的长度。在一般情况下，matches()方法的效率是相对较高的，因为它会使用预编译的正则表达式模式来进行匹配，而不是每次都重新编译正则表达式。
然而，如果正则表达式非常复杂或字符串非常长，可能会影响matches()方法的性能。在这种情况下，建议使用Pattern类和Matcher类手动进行正则表达式匹配，以提高性能并避免不必要的重新编译。
总的来说，matches()方法通常是一个高效的工具，但在处理复杂正则表达式或大量数据时，需要谨慎使用以确保最佳性能。