MyBatis和JPA都是用于在Java应用程序中访问和操作数据库的持久化框架。虽然它们有不同的工作原理和特点，但它们可以在同一个项目中协同工作。
一种常见的方式是使用MyBatis进行复杂的SQL查询和数据操作，而使用JPA进行简单的CRUD操作。这种方式可以充分发挥MyBatis的灵活性和强大的SQL能力，同时利用JPA的简洁和易用性。
另一种方式是使用MyBatis和JPA共同管理实体类。可以使用MyBatis的@SelectProvider注解来定义动态SQL查询，同时使用JPA的@Entity注解来表示实体类。
此外，还可以通过自定义Repository实现类来同时使用MyBatis和JPA。可以在Repository接口中定义JPA的方法，并在其实现类中使用MyBatis执行自定义的SQL查询。
总的来说，MyBatis和JPA可以相互补充，帮助开发人员更好地管理和操作数据库。在实际应用中，可以根据具体的需求和项目情况选择合适的方式来使用这两个框架。