你可以使用以下步骤在PDB数据库中下载文件：
打开PDB数据库的网站（https://www.rcsb.org/）。
在搜索栏中输入你感兴趣的蛋白质或者结构的PDB ID。
点击搜索按钮，找到对应的结果。
点击该结果的PDB ID或者相关链接，进入该蛋白质或者结构的详细页面。
在详细页面中，你可以找到"Download Files"或者类似的选项。点击该选项。
在下载选项中，选择你想要下载的文件类型。常见的文件类型包括PDB文件（原子坐标）、PDBx/mmCIF文件（结构注释）、FASTA文件（蛋白质序列）等。
点击下载按钮，开始下载文件。
注意：在下载之前，你可能需要创建一个免费的PDB账户，以便获得更多的下载权限和功能。