IARC TP53数据库的示例分析

IARC TP53数据库的示例分析，很多新手对此不是很清楚，为了帮助大家解决这个难题，下面小编将为大家详细讲解，有这方面需求的人可以来学习下，希望你能有所收获。

TP53基因，也称之为P53, 是一种抑癌基因，编码一种分子量为53KDa的蛋白质，介导细胞凋亡过程，通过介导癌细胞的凋亡过程，实现抑癌作用。作为最易突变和最重要的肿瘤抑制基因，TP53基因相关突变研究的非常全面和深入。IARC TP53 database收集整理里文献发表和公共数据库中收录的TP53基因上的变异位点，数据库网址如下

http://p53.iarc.fr/Scope.aspx

该数据库收录了以下几种TP53基因相关变异信息

1. 癌症样本中的somatic mutations

2. 癌症患者，家属以及对照的正常样本中的germline mutations

3. human中常见的TP53多态位点

4. TP53突变蛋白的功能评级

5. 不同细胞系中TP53基因的突变信息

6. 小鼠模型中的TP53基因突变信息

7. 实验证据支持的突变

   
   

同时还收录肿瘤患者的临床病理信息，生存数据等相关信息。通关官网的检索系统可以灵活的检索数据，最基本的检索方式是利用突变位点的描述信息，示意如下

可以输入一个或者多个不同水平的突变描述信息进行检索，以C.524G>A为例，检索结果示意如下

给出了对应的genomic, cDNA, protein3个水平的描述，对应的外显子位置，功能影响，和clinvar, cosmic, dbsnp, genomeAD等数据库的链接。除此之外，也可以根据突变位点的不同特征进行检索，示意如下

可以根据碱基突变的类型，所处的外显子，突变是否有害，染色体位置等多种条件进行检索，检索结果的table形式和第一种检索结果相同，对于多个检索结果，可以查看其突变特征和在不同肿瘤中的分布

1. Mutation distribution

查看以下两种信息的分布

1. Mutation type

2. Mutation effects

   
   

Mutation type的结果示意如下

Mutation effects的结果示意如下

2. Tumor  distribution

查看somatic mutations和germline mutations在各种肿瘤上的分布，结果以柱状图展现，结果示意如下

如果需要深入研究TP53基因的相关突变，该数据库非常值得参考。

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