python怎么实现酷酷的云字体

发布时间:2022-05-27 15:58:32 作者:iii
来源:亿速云 阅读:107

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云字体是一种很好的展示方式,可以使人直截了当地看出要展示的主要内容,现在越来越多的  paper  开始使用这种展示方法,尤其适合综述文章。我们可以使用云字体来展示大范围内微生物物种的出现频率  /  概率  /  平均相对丰度等,要做云字体要安装  wordcloud2  软件包。要分析的文件格式即分类学信息及其出现频度(平均相对丰度),如下所示:

python怎么实现酷酷的云字体

读取数据进行做图如下所示:
data=read.table(file="genus_counts_ave.txt", header=T, check.names=FALSE)rownames(data)=data[,1]#对丰度数据进行适当的标准化来更好的显示,可自己选择合适的对数/指数等方法species=rownames(data)counts=data[,-1]counts=sqrt(log(1+counts))data=data.frame(species, counts)#安装软件包并做图install.packages("wordcloud2")library(wordcloud2)wordcloud2(data, rotateRatio=0, size=0.5)
其中  size  设置的图片大小,  rotateRatio=0  表示全部字体不旋转(  1  则表示全部字体旋转),运行结束后会生成云字体图片,如下图所示:

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