R语言中怎么用ggplot2包绘制柱状图

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ggplot2包绘制了展示基因在样本中表达量与数量的柱状图

使用方法:

Rscript lnc_exp.r -h
usage: lnc_exp.r [-h] -i exp_data [-l legend.position] [-o outdir] [-p prefix]
                 [-H height] [-W width]

lnc_exp_Histogram:https://www.亿速云.com/article/1552

optional arguments:
  -h, --help            show this help message and exit
  -i exp_data, --exp_data exp_data
                        input data file path[required]
  -l legend.position, --legend.position legend.position
                        Sets the location of the
                        legend[none,left,right,bottom,top,or two-element
                        numeric vector][optional,default top]
  -o outdir, --outdir outdir
                        output file directory[optional,default cwd]
  -p prefix, --prefix prefix
                        out file name prefix[optional,default lncRNA]
  -H height, --height height
                        the height of the heat map[optional,default 5]
  -W width, --width width
                        the width of the heat map[optional,default 5]

参数说明：

-i 输入基因表达矩阵文件，建议输入标准化过后的表达数据

-l 指定图例的位置，可以设置成none,left,right,bottom,top,or two-element numeric vector

使用举例：

Rscript lnc_exp.r -i All_lnc_gene_fpkm.tsv -l top -p lnc_exp_Histogram

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