如何下载miRNA的5p, 3p 表达量

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参考如下的代码：

# 设置下载的参数
project <- "TCGA-CHOL"
data_category <- "Transcriptome Profiling"
data_type <- "Isoform Expression Quantification"
workflow_type <- "BCGSC miRNA Profiling"
legacy <- FALSE

# 查询可以下载的数据,有时候查询的API不稳定，需要多试几次
query <- GDCquery(project = project,
                  data.category = data_category,
                  data.type = data_type, 
                  legacy = legacy)

# 下载数据
GDCdownload(query = query,method='client')

其关键是设置data_type 为“Isoform Expression Quantification”， 这样就是不同isoform 的表达量。

到此，关于“如何下载miRNA的5p, 3p 表达量”的学习就结束了，希望能够解决大家的疑惑。理论与实践的搭配能更好的帮助大家学习，快去试试吧！若想继续学习更多相关知识，请继续关注亿速云网站，小编会继续努力为大家带来更多实用的文章！