avereps怎么按照相同ID取均值

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aggregate可以对数据分组处理

limma包提供一个函数avereps可以对相同ID的数据取均值，识别的输入数据可以是matrix,MAList或者EList，后两者涉及芯片数据标准化过程，此处仅介绍如何针对matrix数据进行处理。

指定数据如下：相同type取均值

> dat
   type Num1 Num2
1     A   90   89
2     B   34   32
3     C   56   53
4     D   99   95
5     E   15   10
6     A   50   44
7     B   20   13
8     C   24   16
9     D   70   61
10    E   14    4

对数据除type列所有数据，按照type分类ID,取均值，结果：

> avereps(dat[,-1],ID=dat$type)
  Num1 Num2
A 70.0 66.5
B 27.0 22.5
C 40.0 34.5
D 84.5 78.0
E 14.5  7.0

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