Illumina microarray未标准化数据分布的方法

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不同于affy包对affymetrix芯片数据分布绘图，Illumina microarray数据分布是基于lumi包：

boxplot-method

affy包也可以利用boxplot，不过密度图利用hist,此处就展示一些lumi包针对Illumina microarray绘图过程（GSE63229）：

基于lumiR.batch获取LumiBatch对象，直接基于对象画图：

> n.sample = length(LumiBatch$sampleID)> cols=rainbow(n.sample)> par(cex = 0.7)> if(n.sample>40) par(cex = 0.5)> boxplot(LumiBatch,col = cols,  las = 2)

密度图则是(hist同样效果）：

> par(cex = 0.7)> if(n.sample>40) par(cex = 0.5)> density(LumiBatch,col = cols,  las = 2)

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