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bedtools 安装报错
$ wget https://github.com/arq5x/bedtools2/releases/download/v2.25.0/bedtools-2.25.0.tar.gz $ tar -zxvf bedtools-2.25.0.tar.gz $ cd bedtools2 $ make
源码安装,直接make,会报错如下:我的gcc版本:gcc version 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-17) (GCC),
CURRENT_VERSION = Updating version file. * Creating BamTools API - Building in src/utils/FileRecordTools * compiling FileRecordMgr.cpp cc1plus: error: unrecognized command line option "-std=c++11" make[1]: *** [../../../obj//FileRecordMgr.o] Error 1 make: *** [src/utils/FileRecordTools] Error 2
这是因为gcc版本太低,提高版本,make顺利通过:
export PATH=/share/work/biosoft/gcc/gcc-v4.8.0/bin/:$PATH
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