WGCNA怎么根据KME值筛选hub基因

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WGCNA分析中需要找出模块中也就共表达网络中的hub基因：

这里可以根据：KME (eigengene connectivity)值来筛选hub基因：Hub genes are those that show most connections in the network as indicated by their high KME (eigengene connectivity) value

代码部分很简单，输出所有的基因与模块的KME矩阵，然后筛选每个模块中kme最大的前几个基因就是hub基因：

#mergedMEs是经过相似模块合并之后的最终模块对应的模块特征基因：

MEs = mergedMEs


#输出结果：

datKME=signedKME(datExpr, MEs, outputColumnName="kME_MM.")
write.csv(datKME, "kME_MM_test.csv")

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