Java中的contains和indexOf都是用于查找字符串或集合中某个元素或子串的方法，它们的差异主要体现在以下几点：
contains方法用于判断某个元素或子串是否存在于字符串或集合中，返回值为boolean类型，表示是否存在。而indexOf方法用于查找某个元素或子串在字符串或集合中第一次出现的位置，返回值为int类型，表示位置索引。如果不存在，则indexOf返回-1。
contains方法只能用于判断是否存在某个元素或子串，而indexOf方法除了能够判断是否存在外，还可以返回元素或子串在字符串或集合中的位置。
contains方法更为直观和简洁，适合用于判断元素是否存在的情况；而indexOf方法可以进一步获取元素或子串在字符串或集合中的位置，适合用于需要定位元素位置的情况。
总的来说，contains方法用于简单的存在性判断，而indexOf方法用于需要获取元素位置的情况。在实际应用中，根据具体需求选择合适的方法。