Flex与Java集成开发的过程主要涉及以下几个方面：
通信机制：Flex与Java之间的通信可以通过Web服务、HTTP通信或者Socket通信等方式实现。其中，Web服务是最常用的一种方式，可以使用SOAP或者RESTful风格的Web服务。
数据交互：Flex与Java之间的数据交互可以使用XML、JSON或者AMF等格式。XML和JSON是常见的数据交换格式，可以使用Java的XML解析库或者JSON库进行数据的解析和封装。AMF（Action Message Format）是Adobe公司提供的一种二进制格式，可以提高数据传输效率。
客户端与服务器端的协作：在Flex与Java集成开发中，一般将业务逻辑和数据处理放在服务器端（Java）处理，而将界面展示和用户交互放在客户端（Flex）处理。客户端可以通过RPC（远程过程调用）的方式调用服务器端的方法。
数据库操作：Java作为后台开发语言，可以使用JDBC或者ORM框架与数据库进行交互。在Flex中，可以使用数据绑定或者远程对象的方式获取和操作数据库中的数据。
安全性：在Flex与Java集成开发中，需要注意安全性的问题。可以使用SSL加密传输保护数据的安全性，在Java服务器端可以使用安全认证机制，如基于角色的访问控制（RBAC）、OAuth等。
总体来说，Flex与Java集成开发需要处理好客户端与服务器端的通信机制、数据交互、业务逻辑的分离以及安全性等方面的问题，通过合理的架构和设计，可以实现灵活、高效的Flex与Java集成开发。